MICROSATELLITE ANALYSIS OF GENETIC DIVERSITY OF WILD BARLEY (HORDEUM VULGARE SUBSP. SPONTANEUM) USING DIFFERENT SAMPLING METHODS IN IRAN

Document Type : Research Paper

Authors

1 Departmentof of Biology, Faculty of Science, University of Lorestan, Khorramabad, orestan, Iran.

2 Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran.

3 Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran

4 plant Genome Research Unit, National Institute of Agrobiological Science (NIAS),2-1-2Kannondai, Tsukuba, Ibaraki, 305-8602, Japan

Abstract

The genetic diversity patterns of 54 natural populations and 40 individuals of wild barley from different localities in Iran were analyzed using 26 microsatellites markers. At population level, high levels of diversity (0.71), with an average number of 6.92 alleles per locus (ranging up to 17) and high level polymorphism with polymorphism rate averaging 0.67 were observed. Average number of alleles was 38.37 per population (ranged from 36.33 in the Northeast to 38.94 in the West) and 28.42 per individual (ranged from 28.11 in the West to 29 in the North). In dendrograms, accessions collected from the North and Northeast of Iran were grouped away from those collected from the West and Northwest, suggesting the presence of two different wild barley sub genepools in this country. The genetic diversity decreases from the West toward the East. Based on the results of this study the wild Iranian gene pool of barley represents high level of diversity and there is value to search for new useful alleles to incorporate to the breeding programs.

Keywords

Article Title [Persian]

تحلیل ریزماهوارکی از تنوع ژنتیکی جو خودرو (Hordeum vulgare subsp. spontaneum) در ایران با استفاده از روش‌های نمونه‌برداری مختلف

Authors [Persian]

  • حامد خدایاری 1
  • حجت اله سعیدی 2
  • آزاده اخوان 3
  • محمد پورخیراندیش 4
  • تاکاﺋو کوماتسودا 4
1 استادیار گروه زیست شناسی دانشکده علوم پایه دانشگاه لرستان
2 دانشیار گروه زیست شناسی دانشکده علوم دانشگاه اصفهان
3 گروه زیست شناسی دانشکده علوم دانشگاه اصفهان
4 محقق پسادکتری، موسسه نیاس (NIAS)، سوکوبا، ژاپن
Abstract [Persian]

الگوی تنوع ژنتیکی 54 جمعیت و 40 فرد جو خودرو از رویشگاههای طبیعی مختلف ایران با استفاده از 26 جفت نشانگر ریزماهواره مورد آنالیز قرار گرفت. در سطح جمعیتی، مقادیر بالایی از تنوع (0.71) با متوسط تعداد آلل 6.92 آلل در هر لوکوس (تا 17 آلل در هر لوکوس) ومیزان بالایی از پلی­مورفیسم به میزان متوسط 0.67 مشاهده گردید. تعداد متوسط آلل در هر جمعیت 38.37 (از 36.33 آلل در شمال­شرق تا 38.94 آلل در غرب کشور) و در افراد 28.42 آلل در هر فرد (در دامنه­ی 28.11 در غرب کشور تا 29 آلل در شمال کشور) بود. در دندروگرامها، نمونه­های جمع­آوری شده از شمال وشمال­شرق ایران در یک گروه و دور از نمونه­های جمع­آوری شده از غرب و شمال­غرب قرار گرفتند که بیانگر وجود دو زیرخزانه ژنی مخلف در ایران می­باشد. براساس نتایج این مطالعه، خزانه ژنی جو خودرو ایرانی منابع بالایی از تنوع را به نمایش می گذارد که برای اصلاحگران نباتات جهت یافتن آلل­های جدید سودمند می­باشد.

Keywords [Persian]

  • wild barley
  • Genetic diversity
  • gene pool
  • Microsatellites
  • Iran

Files

History

  • Receive Date: 02 November 2013
  • Revise Date: 14 March 2014
  • Accept Date: 28 May 2014

Share

How to cite

Statistics