تعیین تنوع ژنتیکی سه گونه از جنس کارا در ایران با استفاده از تکنیک رپید

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی دکتری / گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان.

2 استادیار / گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان

3 دانشیار / گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان.

چکیده

تمایز گونه­ها در خانواده کاراسه عموما بر پایه صفات ریخت­شناسی است، ولی این صفات تحت تاثیر خصوصیات محیطی قرار می­گیرند. جنس کارا شامل تعداد زیادی گونه می­باشد که تغییر­پذیری مورفولوژیکی زیادی را از خود به نمایش می­گذارند. تکنیک مولکولی رپید برای تعیین تنوع ژنتیکی در سه گونه از جنس کارا در ایران مورد استفاده قرار گرفت. در این مطالعه پنج پرایمر استفاده شدند. لوکوس­های مختلفی برای 17 نمونه از گونه­های Chara vulgaris،  C. gymnophylla و C. zeylanica شناسایی شد. مطالعه حاضر برای اولین بار استفاده از تکنیک مولکولی رپید را در تمایز این گونه­ها در ایران شرح می­دهد. به نظر می­رسد این تکنیک برای تمایز گونه­های این جنس مفید و موثر باشد.

کلیدواژه‌ها


Abrol, D., Bhatnagar, S. & Kumar, S. 2006: Molecular characterization of five species of the genus Chara (division Charophyta) from India. -Journal of Biological Research. 6: 213-220.

Bhattacharya, D. & Medlin, L. 1998: Algal phylogeny and the origin of land plants 1. -Plant Physiology.116: 9–15.

Boegle, M. G., Schneider, S. C., Schubert, H. & Melzer, A. 2010: Chara baltica Bruzelius 1824 and Chara intermedia A. Braun 1859­- Distinct species or habitat specific modifications? -Aquatic Botany. 93: 195-201.

Boegle, M. G., Schneider, S. C., Mannschreck, B. & Melzer, A. 2007: Differentiation of Chara intermaedia and C. baltica compared to C. hispida based on morphology and amplified fragment length polymorphism. -Hydrobiologia. 586: 155-166.

Casanova, M. T. 2005: An overview of Chara L. in Australia (Characeae, Charophyta). -Australian Systematic Botany. 18: 25–39.

Casanova, M. T. 1997: Oospore variation in three species of Chara (Charales, Chlorophyta). -Phycologia. 36:274–80.

Corillion, R. 1957: Les charophycees de France et de Europe Occidentale. -Imprimerie Bretonne, Renne, France.

Hu, Y. J., & Zhou, Z. G. 2001: Extraction of RAPD friendlyDNA from Laminaria japonica (Phaeophyta) after enzymatic dissociation of the frozen sporophytic tissues. -Journal of Applied Phycology. 13: 415-422.

Karol, K. G., McCourt, R. M., Cimino, M. T. & Delwiche, C. F.  2001: The closest living relatives of land plants. -Science. 294: 2351–2353.

Kato, S., Sakayama, H., Sano, S., Kasai, F., Watanabe, M. M., Tanaka, J. & Nozaki, H. 2008: Morphological variation and intraspecific phylogeny of the ubiquitous species Chara braunii(Charales, Charophyceae) in Japan. -Phycologia. 47: 191–202.

Kato , S., Sakayama, H.,  Morishima, H. Sano, S.,  Oomori, Y., Kato, N. Ito, M., Kasai, F. Watanabe, M. M & Nozaki, H. 2010: Morphology and Molecular Phylogeny of Chara altaica (Charales, Charophyceae), a Monoecious Species of the Section Desvauxia. -Cytologia, 75 (2): 211-220.

Krause, W. 1997: Charales (Charophyceae). In: susswasserflora vonmitteleuropa, vol. 18 (Edited by: Ettl, H., Gartner, G. and Mollenhauer), 202 pp. -G. Fischer, Jena, Germany.

Mannschreck, B., T. Fink & A. Melzer, 2002: Biosystematics of selected Chara species (Charophyta) using amplified fragment length polymorphism. -Phycologia. 41: 657–666.

Meiers, S. T., Proctor, V. W. & Chapman, R. L. 1999: Phylogeny and biogeography of Chara(Charophyta) inferred from 18S rDNA sequences. _Australian Journal of  Botany. 47: 347–360.

Moore, J. A. 1986: The current status of the Characeae (stoneworts) in the British Isles. -Watsonia. 12:297–309.

Murray, A. A. & Thompson, W. F. 2002: Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. -Nucleic Acids Research. 8, 4321-4325.

Ramos, J. R., Telles, M. P. C., Diniz-Filho, J. A. F., Soares, T. N., Melo, D. B. & Oliveira, G. 2008: Optimizing reproducibility evaluation for random amplified polymorphic DNA markers. -Genetics and Molecular Research. 7(4): 1384-1391.

Sakayama, H., Kasai, F., Nozaki, H. Watanabe, M. M., Kawachi, M. Shigyo, M. Washitani, I.,  Krienitz, L. & Ito, M. 2009: Taxonomic reexamination of Chara globularis(Charales, Charophyceae) from Japan based on oospore morphology and rbcL gene sequences, and the description of C. leptosporasp. nov. -Journal of Phycology. 45: 917–927.

Sundaralingam , V. S. 2002: Charophyta - a review. In:  Algological research in India. -Singh, B., Singh, M. P. and Dual, D. India. 97-111.

Urbaniak, 2010: Analysis of morphological characters of Chara baltica, C. hispida, C. horrida and C. rudis from Europe. -Plant Systematics and Evolution. 286: 209-221.

Urbaniak, J. 2011: A SEM and light microscopy study of the oospore wall ornamentation in polish charophytes (Charales, Charophyceae) – genus Chara. -Nova Hedwigia. 93: 1-28.

Wood, R. D. & Imahori, K. 1965: Monograph of the Characeae. In: Wood, R. D. and Imahori, K. (editors). A Revision of the Characeae. _J. Cramer, Weinheim.

Yu K. F.& Paula, K. P. 1992: Optimization of the PCR program for RAPD analysis. -Nucleic Acids Research. 20: 2606.

Zhao, F., Liu, F., Liu, J. & Duan, D. 2008: Genetic structure of natural sargassum muticum (Fucales, Phaeophyta) populations using RAPD and ISSR markers. -Journal of Applied Phycology. 20: 191-198.