انتشار مجله گیاهشناسی ایران از سال 1355 شروع شد و در حال حاضر با درجه علمی پژوهشی منتشر می‌گردد که طی نامه شماره 1152/2910/3 مورد تایید وزارت علوم، تحقیقات و فناوری قرار گرفته است. این مجله در فهرست اصلی مجلات  ISI ثبت شده و خلاصه مقالات آن در سایت اینترنتیCABI Publishing  به آدرس www.Cabi-Publishing.Org قرار گرفته است. مجله در پایگاه استنادی علوم جهان اسلام: (ISC)www.isc.gov.ir  و مرکز منطقه‌ای اطلاع رسانی علوم و فناوری (AJCest:www.ricest.ac.ir) نمایه سازی می‌شود. همچنین این نشریه در پایگاه‌ استنادی "اسکوپوس" نمایه گردیده است و براساس اعلام مؤسسه اسکوپوس، در سال 2021 میلادی رتبه Q4 به مجله تخصیص داده شد.